Differences by RAPD-PCR Analysis within and between Rockfish (Sebastes schlegeli) Populations from the Yellow Sea and the Southern Sea in Korea

Differences by RAPD-PCR Analysis within and between Rockfish (Sebastes schlegeli) Populations from the Yellow Sea and the Southern Sea in Korea

황해와 남해산이 각각 50마리씩 총 100마리의 조피볼락(Sebastes schlegeli) 의 DNA를 혈액으로부터 추출하여 30개 의 무작위 primer를 사용한 RAPD(random amplified polymorphic DNAs)-PCR (polymer-ase chain reaction) 방법으로 분석하였다. genomic DNA 의 독특한 특정들이 그 어종군의 특정을 알아내 기 위해서 사용되었다. 30개의 primer중에서 7개의 primer 로부터 증폭된 전체 산물 (307) 중에서 약 67.4% 인 207개의 다형성의 산물 (polymorphic products) 이 나타났고, 1개의 primer 당 약 2.7개의 다양성 의 산물 (polymorphic bands)이 확인되었다. 황해산의 경우 band sharing analysis를 통해서 볼 때 0.22로부터 0.63까지의 bandsharing value 가 확인되었고, 이러한 수치는 0.39±0.02의 평균값을 나타내었다. 황해산과 남해산 2 개체군의 RAPD-PCR 산물의 전기영동적 분석을 통해서 볼 때 황해산 조피볼락의 개체 들 사이에서 변이가 약간 높게 나타났지만 매우 유사한 특정을 나타내었다. 그러나 일부 개체에서 적은 수이지만 polymorphic bands 가 확인되었다. 더 많은 개체군과 다른 연구방법을 통한 연구가 있어야 되겠지만, 이러한 결과는 RAPD 방법을 통하여 2 지역산 조피볼락의 유전적 차이를 어느 정도 확인할 수 있는 가능성을 제시해 주고 있다.

Polymerase chain reaction (PCR) amplification of DNA as 30 different arbitrary primers and random amplified polymorphic DNAs (RAPD) analysis were performed on genomic DNA extracted from the blood of the marine rock fish (Sebastes schlegeli) from the Yellow Sea and the Southern Sea. The unique properties of the genomic DNA were used to investigate the features of the population dynamics and origins of the species. Out of 30 primers, seven generated 207 highly reproducible RAPD polymorphic products, producing approximately 2.7 polymorphic bands per primer. About 67.4% of total amplified products (307) were either polymorphic (207) to rock fish. The degree of similarity varied from 0.22 to 0.63 as calculated by band sharing analysis. Also, the average level of band sharing was 0.39 :to.02 within the rock fish strains. The electrophoretic analysis of RAPD-PCR products showed the relatively high levels of variation between different individuals in rock fish from the Yellow Sea. However, the RAPD outlines obtained with DNA of different rock fish strains from the Yellow Sea and the Southern Sea in Korea were very similar. Also, a small number of polymorphic bands were identified. Even if further analyses or more rockfish populations are required, this result implies RAPD analysis reflects genetic differences between the geographical strains of the rockfish.