온몸의 연속절단면영상 만들기

Manufacture of the Serially Sectioned Images of the Whole Body Third Report: Methods for Manufacture of the Segmented Images, Coronal Segmented Images, and Sagittal Segmented Images

온몸의 연속절단면영상이 있으면 온몸을 3차원영상으로 재구성할 수 있고, 각 해부구조의 구역화영상이 있으면 각 해 부구조를 3차원영상으로 재구성할 수 있다. 이 연구에서는 해부영상에서 보이는 피부, 뼈, 간, 허파, 콩팥, 방광, 심장, 뇌의 테두리를 구역화하기로 하였고, 소화관, 호흡관, 동맥 내강의 테두리를 구역화하기로 하였다. Adobe Photoshop에서 자석올가미도구를 써서 해부구조의 테두리를 따라서 선택을 반자동으로 그리고 고친 다음에 올가미도구를 쓰거나 작업패스를 거쳐서 선택을 수동으로 고쳤다. 선택 속에 빛깔을 채워서 구역화영상을 만들었다. 모든 구역화영상의 행과 열을 쌓아서 관상구역화영상과 시상구역화영상을 만든 다음에 관상구역화영상과, 시상구역화영상을 살펴서 틀린 구역화영상을 찾았고, 틀린 구역화영상을 고쳤다. 이 연구에서 마련한 구역화영상 8,507개는 간격이 0.2mm였고, 해상도가 3,040×2,008였고, 화소크기가 0.2mm였고, 빛깔이 8 bits color였다. 따라서 구역화영상 1개의 파일크기가 5.8 Mbytes였고, 8,507개의 파일크기가 48.3 Gbytes였다. 이 구역화영상을 바탕으로 해부구조의 3차원영상, 가상해부 소프트웨어, 가상내시경 소프트웨어를 만들면 해부학과 내시경을 익히는 데 도움이 될 것이다.

While three dimensional (3D) images of the whole body can be reconstructed by using the serially sectioned images, 3D image of each anatomical structure can be reconstructed by using the segmented images. In this research, outlines of skin, bones, liver, lungs, kidneys, urinary bladder, heart, and brain in the anatomical images were decided to segment, and luminal outlines of digestive tract, respiratory tract, and arteries were decided to segment too. On the Adobe Photoshop, selections were semiautomatically drawn along outlines of the anatomical structures and semiautomatically corrected using magnetic lasso tool. Successively, selections were manually corrected either using lasso tool or through work path. The selections were filled with colors to make segmented images. By stacking rows and columns of the segmented images, coronal and sagittal segmented images were made. The coronal and sagittal segmented images were observed to find incorrect segmented images, which were revised. 8,507 segmented images with 0.2 mm intervals, 3,040×2,008 resolution, 0.2 mm pixel size, and 8 bits color depth were achieved, so that file size of 1 segmented image and 8,507 segmented images was 5.8 Mbytes and 48.3 Gbytes, respectively. These segmented images will be the basis for the development of 3D images of the anatomical structures and software of virtual dissection and virtual endoscopy, which are helpful in studying anatomy and endoscopy.