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KCI등재 학술저널

18주 태아 뇌에서 발현하는 FB174 cDNA의 유전체 DNA 분리 및 염색체 위치

Human Genomic DNA Isolation and Chromosomal Localization of Fetal Brain cDNA (FB174)

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최근 사람 유전체 사업의 진행으로 수많은 유전자들이 발굴되고 다양한 실험방법들이 개발되고 있으나 발굴한 유전자들 의 기능을 예측하고 염색체 위치를 결정하는 것은 용이하지 않다. 이 연구에서는 태아의 뇌 형성이 활발한 시기인 태생기 18주의 뇌로부터 cDNA probe pool을 작성하고, 염기서열을 분석 하였다. 이 중에서 FB174를 선택하여 흰쥐 조직 절편에 대한 in situ hybridization 조직 화학법을 시행하여 그 발현양상을 관찰하였다. 염색체 위치를 규명하기 위하여, 사람 유전체 서고 검색을 시행하여 사람 유전체 DNA를 분리하였고, 이 유전체 DNA를 biotin으로 표지한 후 형광 in situ hybridization을 시행하였다. 서열분석과 GenBank 자료분석에서 FB174 클론은 사람염색체 13q14에 위치한다고 알려진 번역 수준에서 조절되는 암 단 백질(TCTP)과 매우 유사한 것으로 나타났다. FB174 클론의 mRNA를 흰쥐 조직 절편에 in situ hybridization 조직 화학법을 시행한 결과 발현을 관찰할 수 없었다. 분리된 FB174 클론의 유전체 DNA로 형광 in situ hybridization 시행한 결과 염색체띠 7q22에 위치함을 확인하였다. 이상의 결과에서 FB174 유전자는 기존에 알려진 TCTP 유전자의 서열과 매우 높은 유사성을 고려할 때 그와 관련된 새로운 유전자일 것으로 추정된다.

Eventhough surmountable amounts of genes are being cloned and a number of methods are being developed by human genome project, it’s not easy to predict possible functions of genes and determine the chromosomal locations of genes. In this experiment, cDNA pool was made from 18 weeks old human fetal brain and analyzed the sequences. FB174 clone was chosen, in situ hybridization histochemistry was performed on developing and adult rat tissue section to observe the tissue specificity and developmental expression of this gene. To observe the chromosomal location of FB174 clone, the genomic DNA from human genomic library was isolated and fluorescence in situ hybridization was carried out. By sequencing and sequence search with GenBank data it was revealed that cloned FB174 cDNA was quite similar to translationally controlled tumor protein which is known to locate to human chromosome 13q14. The expression of FB174 mRNA was not detected in rat tissue sections by in situ hybridization histochemistry. Fluorescence in situ hybridization using biotin labeled FB174 probe resulted in specific labeling of human chromosome 7q22. These results and high sequence homology of FB174 to known translationally controlled tumor protein suggest that FB174 clone may be a new translationally controlled tumor protein-related gene.

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