Whole Exome Sequencing of a Patient with Duchenne Muscular Dystrophy

듀센형 근이영양증 환자의 엑솜 시퀀싱

듀센형 근이영양증은 소아에서 가장 흔하고 치명적인 유전성 근육질환으로, 디스트로핀 유전자의 변이로 인해 발생한다. 디스트로핀 유전자의 결실이나 중복에 의해 생기는 경우가 많으므로 MLPA나 aCGH가 진단을 위해 많이 쓰인다. 그러나 환자의 1/3 에서는 변이가 발견되지 않는데, 이럴 경우 direct sequencing을 통해 MLPA나 aCGH에서 확인되지 않는 미세한 결실, 중복, 또는 point mutation이 있는지 확인하게 된다. 그러나 DMD 유전자는 크기가 매우 크기 때문에 direct sequencing을 하기에는 시간과 비용이 엄청나게 소모되며 최종 결과도 확정적이지 않을 가능성이 있다. 우리는 MLPA에서 변이가 발견되지 않은 진행성 근이영양증 환자를 대상으로 whole exome sequencing을 시행하였는데, 디스트로핀 유전자의 frame shift mutation이 발견되었다. 환자의 어머니를 대상으로 시행한 direct sequencing에서도 환자와 같은 변이가 발견되었다. Whole exome sequencing은 MLPA에서 변이가 발견되지 않는 듀센형 근이영양증 환자의 새로운 진단 도구로 훌륭한 역할을 할 수 있을 것으로 생각된다.

Duchenne muscular dystrophy (DMD) is the most common and lethal dystrophy in childhood, caused by mutations in the dystrophin (DMD) gene. Multiplex ligation dependent probe amplification (MLPA) or array comparative genome hybridization (aCGH) is widely used as an initial molecular diagnostic tool. If no deletions or duplications are found in MLPA or aCGH, the samples must be subjected to a second test of direct sequencing. Direct sequencing of the DMD gene, however, is timeconsuming, high-cost, and can be inconclusive. Here, we performed whole exome sequencing on a patient with progressive muscle weakness whose MLPA result was negative; the result revealed a rare frame shift mutation. Direct sequencing on the patient's mother showed the same mutation. Whole exome sequencing can be a new diagnostic routine for DMD patients with negative MLPA3