RAPD를 이용한 한국 포도 품종의 계통유연관계 분석

Analysis of Genetic Relationships of Grapevine Cultivars (Vitis ssp.) in Korea Using RAPD Markers

본 실험은 29개 포도 품종(Vitis spp.)의 효율적 유전학적 유연관계를 분석함으로써 포도품종 육성을 위한 기초자료로 이용하고자 RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA) 방법을 이용하여 분석하였다. 총 60개의 프라이머를 이용하 여 558개의 다형성 밴드를 얻었다. 획득된 다형성 밴드를 사용하여 UPGMA(unweighted pair-group method arithmetic average) clustering 분석 결과, 포도 품종은 유사도 0.588을 기준으로 나누었을 때 6개 그룹으로 분류되었다. 가장 높은 유사도 값(0.980)을 나타낸 것은 국내 육성 품종인 “흑보석”과 “수옥” 품종이었고, 가장 낮은 유사도 값(0.404) 을 나타낸 것은 프랑스 품종인 “S. 9110”과 일본 품종인 “Super Hamburg”로 나타났다. “Super Hamburg”는 첫 번째 그룹(I)에 구성되었다. 두 번째 그룹(II)은 “원교 라-23”과 “Muscat Hamburg”, “Tano Red”, 그리고 “탄금추”가 포함되어 있었다. 세 번째 그룹(III)은 “Alden”, “원교 라-21”, “원교 라-30”, 그리고 “Dutchess” 품종이 속해있었다. 네 번째 그룹(IV)은 14개 포도 품종이 포함되었으며(“흑구슬”, “흑보석”, “수옥”, “원교 라-29”, “원교 라 -22”, “거봉”, “Pione”, “홍이두”, “Golden Muscat”, “진옥”, “두누리”, “캠벨얼리”, “Delaware”,“Schuyler”), 거봉 계열의 5 품종과 캠벨얼리 계열의 4 품종 그리고 이들의 교배조합에 사용된 품종이 포함되어 있었다. 다섯번째 그룹(V) 3개 품종으로 구성되었다(홍단’, “탐나라”,“홍이슬”, “Himrod seedless”). 여섯 번째 그룹(VI)은 “청수”와 모본인 “S. 9110”이 포함되었다. 본 실험의 결과는 DNA 수준에서 포도의 교배육종에 이용할 양친의 선정이나 육종연구에 기초 자료가 될 수 있을 것으로 기대된다.

In this study, we used the random amplified polymorphic DNA (RAPD) technique to evaluate the genetic relationships among 29 grapevine cultivars (Vitis spp.). Sixty selective primers detected a total of 558 polymorphic bands. By UPGMA (unweighted pair-group method arithmetic average) cluster analysis with 558 polymorphic bands, the 29 grapevine cultivars were divided into six major groups at 58.8% genetic similarity. The “Super Hamburg” was clustered in group I. Group II consisted of “Wonkyo RA-23”, “Muscat Hamburg”, “Tano Red”, and “Tankeumchu”. Group III consisted of “Alden”, “Wonkyo RA -21”, “Wonkyo RA-30”, and “Dutchess”. Group IV included 14 grapevine cultivars (“Heukgoosul”, “Heukbosuk”, “Suok”, “Wonkyo RA-29”, “Wonkyo RA-22”, “Kyoho”, “Pione”, “Beniizu”, “Golden Muscat”, “Jinok”, “Doonuri”, “Campbell Early”, “Delaware”, and “Schuyler”). Group V consisted of “Hongdan”, “Tamnara”, “Hongisul”, and “Himrod seedless”. Group VI included 2 cultivars (“Cheongsoo”, and “S. 9110”).