Transcription factor와 DNA간의 상호작용 확인을 위한 실험 기법

Experiments for researching transcription factor-DNA interaction

유전정보는 생명체의 모든 정보를 담고 있는 물질이지만 이를 해석할 때야 비로소 생명현상을 이해할 수 있다. 유전정보를 해석할 때, 유전자의 전사를 조절하는 단백질인 transcription factor(TF)의 기작을 이해하는 것은 가장 선행되어야 하는 일이며, 이를 위하여 electrophoretic mobility shift assay(EMSA)실험 기법과 chromatin immunoprecipitation-sequencing(ChIp-seq)실험 기법이 개발 되었다. 그러나 TF의 복잡한 기작을 분석하려면 더 높은 정확도와 많은 양의 정보를 확인하고 가공할 수 있는 실험이 필요하다. 몇 년 사이에 새롭게 출현한 유전자 서열분석기술과, 유전자 편집 기술은, 기존의 실험방법에 적용되어 더욱 발전한 형태의 TF관련 실험들을 출현하게 하였다. 새로운 실험기법들은 TF에 대한 더 깊이 있는 이해를 가능하게 한다. 본 리뷰는 TF연구분야에서 다루어지고 있는 기존의 실험 기법과 새로운 실험 기법들 중에서, 효율적이면서도 소규모 대학원 실험실에서도 실험이 가능한 실험기법들을 선별하여 이에 대한 원리와 실험 과정에 대한 정보를 제공하고자 한다.