창업벤처기업 세액감면제도의 벤처기업 확인과 조세특례제한법 제6조 제2항의 해석 : 서울행정법원 2017. 6. 30. 선고 2017구합56933 판결 사안을 중심으로

A Study on the Problems of Certification of Venture Businesses in the Tax Reduction and Exemption System for Startup Venture Businesses and the interpretation of Article 6 (2) of the Restriction of Special Taxation Act - Focusing on Seoul Administrative Court Decision 2017Guhap56933 Dated June 30, 2017

본 연구는 조세감면 범위의 확대 적용 대상을 둘러싼 구체적인 조세쟁송 사례를 바탕으로 벤처기업육성을 위한 세액감면제도의 합리적인 운영방안을 제안한다. 창업벤처중소기업 등에 대한 소득세와 법인세 감면을 규정하고 있는 조세특례제한법 제6조 제2항은 당초에 창업 후 3년 이내에 벤처기업 확인을 받은 경우 최초로 소득이 발생한 과세연도로부터 4년간 세액을 감면하도록 정하고 있었다. 이후에법이 개정되면서 감면대상 기간이 4년에서 5년으로 확대되었고, 해당 개정규정에 대한 부칙에서는“2013년 1월 1일 이후 창업, 지정 또는 확인받는 분부터 적용한다”고 규정하였다. 당시 벤처기업 확인의 유효기간이 2년으로 정해져 있었기 때문에 유효기간이 만료되는 경우 신규 벤처기업과 동일한신청 및 평가 절차를 거쳐 다시 벤처기업 확인을 받아야 했고, 창업 후 3년 이내에 최대 두 번의 벤처기업 확인을 득하는 것이 가능하였다. 이에 벤처기업으로 최초확인을 받은 후 유효기간의 만료로2013년 1월 1일 이후 재확인을 받은 기업의 경우도 개정된 법에 따라 확대된 5년의 감면기간을 적용받을 수 있는지 여부가 쟁점이 되었다. 과세당국과 법원은 개정된 조특법의 부칙에서 규정하고 있는확인이란 ‘최초 확인’만을 의미한다고 해석하는 것이 입법연혁 및 취지에 부합한다고 보았다. 그러나본 연구는 쟁점 규정을 문언 그대로 해석하지 않고 ‘최초 확인’으로 축소해석하는 경우 발생하는 문제점을 다양한 사례를 바탕으로 보여주고자 한다. 이를 통해 쟁점 규정을 문언 그대로 엄격하게 해석하는 것이 조세법률주의와 조세평등주의에 비추어 타당함을 논증하였다. 본 연구는 벤처기업 육성을 위한 조세지원제도의 합리적인 운영방안을 조세법의 적용과 해석의 측면에서 제시하였다는 점에서 공헌점을 가진다.

Article 6 (2) of the Restriction of Special Taxation Act, which stipulates corporate tax reduction or exemption for start-up small and medium-sized enterprises(SMEs) venture businesses, initially stipulated that if a venture business is certified within three years of establishment, the enterprise is entitled to an income tax reduction for four years from the taxable year in which first income accrues. Subsequently, with the revision of Article 6 (2) in 2013, the period subject to reduction or exemption was expanded from four to five years, and the supplementary provisions for the revised regulations stipulated that “applicable to those who have been established, designated or certified after January 1, 2013.” In order to be certified as a venture business, the “requirements for a venture business” must be met in accordance with the Venture Business Act, and an application for certification of a venture business must be made to the head of the confirmation agency. The Enforcement Decree of the Venture Business Act sets that the valid period of the venture business certificate as two years. Therefore, if the validity period expires, it is necessary to go through the same application and evaluation procedures as for a new venture company, and to receive certification of the venture company again. Therefore, it is possible to obtain two certifications of venture companies within three years after starting a business. Accordingly, controversy arose over whether the extended five-year reduction/exemption period can be applied according to the amended law in the case of a company re-certified after January 1, 2013 due to the expiration of the validity period after initial confirmation as a venture business. Under the Special Taxation Act, the tax reduction or exemption for start-up ventures is very effective support for the survival of venture companies, so the effect of the one-year extension of the reduction period due to the revision is significant for venture companies. Since then, there have been several authoritative interpretations of the subject of the amended Act, and the court has ruled that it is in line with the legislative history and purpose to interpret the certification stipulated in the supplementary provisions of the amended Act to mean only “initial certification.”…