基于RSeQC 的丹参、葛根转录组测序质量分析

本文基于RSeQC 工具中的多个读序质量分析模块，分别对丹参与葛根的转录组高通量测序读序进行了质量分析。从比对质量、核苷酸插入率、GC 含量测定、重复读序检测以及碱基错配等多个角度，本文分别总结了丹参与葛根转录组读序的测序质量。结果显示，丹参和葛根的转录组读序整体质量较好，但部分读序的碱基质量不高。本研究不仅对丹参与葛根的转录组测序质量进行有效评估，而且未来有助于优化实验设计，提高测序质量，为药用植物的转录组测序质量评估提供研究基础。