TIMSS 2003에서 공개된 과학문제집을 이용하여 2006년 2월에 한국의 초등학교 4 년생을 대상으로 조사를 행하고, 이 조사결과에서 얻어진 데이터를 바탕으로 한국과 일본의 초등학교 4학년 아동들의 과학성취도 비교를 행하였다. 분석항목으로서는 영 역별 정답률, 국제수준점 문항의 정답률, TIMSS 1995와의 동일 문제에 있어서의 정 답률을 중심으로 고찰하였다. 또한 구체적인 문항 분석을 통하여, 양국의 아동들이 가 지고 있는 과학적인 개념 및 오개념 등의 현황을 살펴보았다. TIMSS 2003의 초등학교 과학문항의 평균 정답률은 한국이68.7%이고 일본은 67.0%였다. 양국 모두 국제평균치보다 높았고 참가국 가운데에서 상위에 속하였다. 대 부분의 문항에 대한 양국 아동의 정답률은 같지만, 이수 시기나 이수내용에 따른 차 이가 보였다. 또한 해답지로부터 아동들이 가지고 있는 개념의 현황에 대하여 분석할 수 있었고, 앞으로의 지도에 도움이 되는 데이터가 얻어졌다.